南京军区南京总医院全军临床医学检验中心是1979年全军第一批组建的医学专科中心之一，在国内医学检验专业同行中具有较高的知名度，2001年被评为江苏省医学检验专业唯一的医学重点学科。

检验中心下设细胞体液检验、寄生虫检验、凝血止血、生殖遗传、临床微生物、临床免疫、临床生化、分子生物学、门急诊检验9个专业实验室和临床免疫、血脂、生殖遗传、分子生物学4个研究室，其中临床免疫、临床生化和生殖遗传是中心的3个主要特色专业和发展方向，均处于国内领先水平。检验中心现有实验室面积2500余平方米，仪器设备总价值1500万元，开展的常规检查项目达500余项，年工作量200万件；设有男性不育和免疫风湿病专科门诊。

 中心现有专业技术人员42人，其中教授7人，副教授5人； 博士后指导老师2人，博士研究生导师1人，硕士研究生导师5人；本科学历以上人员占73.8%，其中博士(含在读)9人，硕士4人。中心成立以来共获科研成果奖154项，其中国家三等奖1项，军队、省部级二等奖18项、三等奖77项、四等奖58项；发表论文1300余篇，其中有29篇被SCI收录；近三年来每年发表论文达70篇以上，被SCI收录3～5篇；主编专著15本。获各类科研基金资助100余万元，承担国家部委或省部级科研课题11项。中心共培养博士后1人(在读)，博士研究生1人(在读)，硕士研究生24人(3人在读)；接收专修班、进修、实习学生1560人。现为南京大学医学院临床基础教研室。